우주 세기 0079, ‘일년전쟁’ 말기, 지구연방군과 지온공국군의 싸움에서 지온공국군의 공격을 받은 사이드 4의 무어가 궤멸했다. 살아남은 무어의 시민들로 구성된 지구연방군 소속 무어동포단이 자신들의 고향 썬더볼트 우주구역의 탈환을 결의하는 한편, 지온공국군은 거기에 대항하며 리빙 데드 사단을 전개한다. 무어동포단의 에이스 파일럿 이오 플레밍과 리빙 데드 사단의 에이스 스나이퍼인 데릴 로렌츠는 숙명의 싸움에 도전한다.​